此前，时任直隶总督兼北洋大臣的李鸿章，为给其北洋军培养人才，在天津办了一所仿照西洋军事学院模式的北洋武备学堂；后因八国联军侵入天津校舍被毁，袁世凯接任后将其迁至保定，更名为了北洋陆军速成武备学堂，即俗称之“保定军校”。
而两江总督张之洞也于一**二年曾在南京城北妙耳山也办了一所“江南陆师学堂”，后因故停办。魏光焘接任两江总督后，即于一九○三年在南京重新开办了“江南武备学堂”。
而另一所“山西武备学堂”，也于光绪二十九年在太原应运而生了。
于是，许多精英人才、有志之士有的进国内的这些武备学堂；有的出国留学深造，较多的则是东渡日本进士官学堂；学成后即潜身于新军之中，以待来日一显身手。
由此，各省的新军中就有了一大批能够接受新思潮的热血青年，而满清皇朝已经为自己准备好了一批掘墓人。华夏大地上一场即将来临的革命风暴已在酝酿与孕育之中了，大清皇朝将在这场摧枯拉朽的革命风暴中倾倒。
正在慈禧太后欲推行新政之时，却节外生枝地冒出了一件令老佛爷骇然之事。
原来，唐才常的自立军起义失败后，康有为与梁启超等人虽然对于武力营救光绪皇帝已失去了信心，但仍不甘心就此罢休；只是认定了“维新变法之所以失败的原因，就在于有慈禧太后在之故；而今，光绪皇帝被囚禁，欲救皇上，得先除掉慈禧。”也因此，康有为与梁启超萌生了刺杀慈禧太后的打算。
光绪三十年，康有为派遣自己的保镖、颇具游侠风范的广东顺德人梁铁君，潜入北京伺机刺杀慈禧太后。
于是，梁铁君化名吴道明在北京城内开了爿吉昌照相馆；不久，即与宫里的太监混熟，也就能出入于东华门等地了。然而，大清朝的宫闱毕竟森严，时间飞快地过去了两年，梁铁君却迟迟找不到可下手的机会。
时至光绪三十二年，慈禧太后打算实施新政，维新派也已气馁准备放弃刺杀计划了；谁知，此年八月，心无城府的梁铁君在与一位广东老乡朱淇的言谈中，透露了自己进京的使命。
殊不知，朱淇正是津榆铁路侦察处探员杨以德放出的鹰犬；杨以德获知这一情报后，密告上司直至袁世凯，袁世凯立即将梁铁君及协助其行事的北京警厅西分厅四区区官范履祥抓获。
因案情重大，袁世凯不敢擅自处理，赶紧禀告慈禧太后请旨定夺。
慈禧太后闻报后果然惊愕了，想不到康、梁一党竟敢派人谋刺于她，更是恨之入骨了。然因，此时的慈禧太后正欲推行新政，唯恐此事泄露引起不利于清庭的更大反响；所以，指使袁世凯秘密处置。
于是，几天后，袁世凯下令将俩人毒毙，一桩惊天大案就这么悄无声息地被破解了。
袁世凯在破获谋刺案中建了大功，慈禧太后当然要给予犒赏；于是，将推行新政的要务交给了袁世凯。
破获谋刺案后，为了化解国人对满清皇朝的敌视，慈禧太后觉得更应该推行新政了。
于是，一九○六年九月一日，清皇朝又颁发一道上《谕》，决定加快推行新政的步伐，实行预备立宪并改革现行官制。
《谕》曰：“目前规制未备，民智未开，若操切从事，涂饰空，何以对国民而昭大信。故廓清积弊，明定责成，必从官制入手，亟应先将官制分别议定，次第更张。”
因为，改革官制直接关系到官僚们的切身利益；因此，京官、外臣可就忙开了，谁都不想失去头上的顶戴，有的则想从中捞取一些利益。
于是，朝中分别以瞿鸿禨和袁世凯为首的两股势力，则暗中较劲了。
瞿鸿禨和湖广总督张之洞联手，袁世凯则用重金买通了庆亲王奕劻；所以，双方可谓是势均力敌。
且瞿鸿禨是科举进士，袁世凯是戎马出身；一个视其为迂腐，一个视其为草莽；谁也瞧不起谁，谁也不买谁的帐。故而，在这场预备立宪中，双方剑拔弩张地皆欲一决雌雄，非拼个你死我活不可。
因为，当时的满清皇朝设有吏、户、礼、兵、刑、工等六部，另有都察院、大理寺、太常寺、翰林院、军机处等机构；各机构的人员常无定编，职责也不甚明确；有的重叠，有的错位，犹如一团乱麻。所以，改革官制且如要将此团乱麻理清繁复得很。
而最伤脑筋的是官制的编定，因为这关系到众多闲曹与冗员的裁撤去留；为此，朝庭特意设置了一个编制馆，负责具体的官制编订事务。按，官制编订事关重大，理应由满清权贵、辅国公载泽主持；然而，此时的袁世凯很受老佛爷的青睐；所以，也让袁世凯承手办理。
袁世凯有了如此一个扩张势力、培植党徒的机会，自然高兴。而载泽等人不知就里，却甚感不悦了。
一个月后，袁世凯主持的编制馆拿出了《新官制改革方案》，欲对现行官制实施全面改革。
《方案》中除了将原有的各部、处、院、寺裁撤、兼并外，还拟增设责任内阁、资政院、行政裁判院、集贤院、审计院等新的机构。
因为，如此大刀阔斧的官制改革牵涉面广，许多官僚会因此失去权位；所以，《方案》一出台就招致了群臣的反对。
满清宗室、朝中百官群起发难，“反对实施改革，主张保留旧制”的《奏章》不断。
内阁中书王宝田、户部郎中李经野等人则声称：“改革官制，乃以夷变夏，乱国法而惑人心，有四谬六弊，断不可取。”
御史张瑞荫、吏部主事胡思敬则言：“内阁权重于朝庭，必出佞臣，不可轻设；军机处代君议事，不可言废。”
内阁学士海干脆直斥袁世凯：“操纵宪制，败坏国家；阴夺君权，居心叵测。”
同时，四处传言：“一旦改革官制，内务府也要裁撤，满清宗室都得让位于汉人，连宫中太监也都会被驱除。”一时间，人心惶惶了。
于是，满清宗室的王公、贝子，甚至于太监们；都纷纷到老佛爷面前泣诉，言袁世凯的“不是”。
此时，北洋新军中唯一的满人将领、镶白旗人铁良则面奏慈禧太后，攻讦袁世凯：“心存叵测，须早加抑制；若满人势力被削，大清还能依重于谁？”
瞿鸿禨也趁机进言：“袁世凯欲立内阁，祸心弥天；军机处断不可撤，以期制约。”
如此种种议论，把个慈禧太后闹得心烦意乱了；她想不到立宪尚未实施，朝臣之间却已争得不可开交了。不过，对于玩惯了权术的她来，这倒是利于她驾驭与控制，又何尝不好？
然而，欲行新政、立宪、改革官制等都是她亲自倡导的，岂能就此罢休半途而废？
而对于袁世凯，慈禧太后心中自然有数；只因他在灭拳匪、办新军、破获谋刺案中屡有建功，才给予的褒奖以慰其心。
而在慈禧太后眼中，袁世凯毕竟只是一介武夫，无非是宵之辈；此人有权欲，但还不至于吃了豹子胆敢犯上作乱，大可不必杯弓蛇影的胆如此；特别是经谋刺案后，慈禧太后倒是觉得可以放心了。
不过，瞿鸿禨所言也有其理；因为，目下的袁世凯确已集权过重，有道是权重盖主，略加制约看来也有必要。
而满人是大清的根基，推行新政固然需要，但归根到底却不可损害满人的利益；否则，自己的这个宝座失去了基础也就不稳了。
而军机处、内务府是大清朝皇权的象征；皇权不允撼，这些机构当然也是轻易更变不得的。
慈禧太后如此思虑后，既没有采纳众议罢绌袁世凯，也没有全盘接受袁世凯的《新官制改革方案》；而是给官制改革定下了“五不议”原则，即：“军机处事不议、内务府事不议、翰林院事不议、八旗事不议、太监事不议。”如此一来，袁世凯的手脚就被捆住了，只好顺着慈禧太后的意愿修改官制改革《方案》了。
慈禧太后定了调后，袁世凯被迫修订了《官制改革草案》。
结果，非但军机处、内务府、翰林院不能碰外，连都察院也原封不动；大理寺只是改了一个字，更名为大理院。
不过，资政院与军咨府倒是增设了；但是，原欲增设的集贤院、行政裁判院却没能批准。
而立宪中的关键、设立责任内阁一事，倒是准予同意了。
同时，六部中除了礼部、吏部保留外，其他各部均被裁撤。
审议后，同意另设了外务、民政、陆军、法、学、农工商、理藩、邮传、度支等部门。
并规定了“各部只设尚书一人，侍郎二人”
，“内阁也只设总理大臣一人，协理大臣二人，各部尚书同为内阁政务大臣”
。
至此，袁世凯主持的官制改革总算有了落实；虽然，《草案》中拟议的内容没能完全通过，但实施了部分；终于理清关系明确权责，也算是有成果。
