然后，杨希闵俨然以广东督办的名义，任命其部将滇军第一军第二师师长赵成梁为广东省长，另一名部将滇军第一军第五师师长周自得为广州卫戍司令，政府其他各部门的官员也都重新进行了任命。
同时，“滇、桂联军”还占领并封锁了各交通要道及车站、港口、邮局等战略要地；并由刚任命的广州卫戍司令周自得出面，宣布广州全城实施戒严。
就这样，杨希闵与刘震寰明目张胆地向广东政府夺权；从而，公开进行反叛了。
对于杨希闵与刘震寰公开反叛，广东政府立即做出反应；免除了杨希闵与刘震寰的本兼各职，并下达了对俩人的《讨伐令》，命令“‘东征军’回师平叛”。
但因考虑到败走江西的林虎、洪兆麟，仍有回窜的可能，决定许祟智留驻汕头以示威慑。
所以，只抽调了驻于兴宁、梅州等地的黄埔教导团及许济所部的“建国粤军”，组成一支“平叛联军”，由蒋介石任联军总指挥。
此前，根据廖仲恺的提议，黄埔军校的两个教导团已于四月十三日合并，改编为了党军第一旅，何应钦升任为了旅长；而此时的许济也已因功升任为了“建国粤军”第四师师长，军力皆有扩充。
蒋介石受命后即率部从兴宁、梅州驻地起程回师，驻于北江的“建国湘军”总司令谭延闿、“建国滇军”总司令朱培德也率部沿粤汉铁路南下；如此，两路钳制必欲铲除叛军收复广州。
此时，叛军也已作了相应部署。
刘震寰的桂军驻防于白云山，以抵御由北江南下的朱培德、谭延闿等部；杨希闵亲率主力部队滇军第一军驻防于东莞，以迎战由粤东返回的“东征军”。
入粤的滇军原有三个军，因范石生的滇军第二军入桂驰援新桂系去了，尚在广州的另有一支滇军第三军。然而，因该军军长胡思舜不愿意参与叛乱；杨希闵恼羞成怒即将胡思舜的兵权褫夺了，由时任前敌总指挥的赵成梁接管滇军第三军。
然后，杨希闵命令赵成梁率部渡过珠江，欲袭取位于河南士敏土厂内的大元帅府。
然而，赵成梁率部渡江时，却遭到了大本营参军长吴铁城与驻守于珠江南岸的“建国粤军”第三军军长李福林的顽强抵抗。赵成梁难以进取只得退回江北，杨希闵欲袭取大元帅府的企图未能得逞。
不日，蒋介石率部抵达广州，即与叛军在瘦狗岭、龙眼洞、樟木头等地激战。
按，此时的叛军在数量上仍占有优势；然而，滇、桂军自从进入广东后，几年来在捞足肥水的同时，每个官兵手上都多了一枝烟枪；如此的队伍，其战斗力也就可想而知了。
而刚取得东征胜利的党军与“建国粤军”却是土气高昂；且黄埔学生兵出征时受到杨希闵与刘震寰的鄙视，那股窝囊气还没有出，正欲趁机发泄；现在回穗平叛，正是与杨希闵、刘震寰算账的机会；因而，遭遇滇、桂军时，个个如饿虎扑食似地勇猛无比了。
滇、桂军难抵，只得退守瘦狗岭、龙眼洞等地；凭借易守难攻的地理优势才勉强抵住，但没过几天就渐感难支了。
而此时，广东政府又发表了《告滇、桂军士兵书》，号召滇、桂军士兵“回归革命军，莫为杨希闵与刘震寰卖命”。
这一招，果然对于分化瓦解叛军产生了作用。
胡思舜所部滇军第三军，本来就不愿参与反叛；被赵成梁接管后，将士们均不服其节制；于是，纷纷倒戈了。滇军第三军将士的倒戈，无疑是对杨希闵、赵成梁的沉重打击。
更为奇巧的是，六月十四日，苏联顾问契齐班诺夫用废弃于黄埔港中的飞鹰号战舰上的大炮助战，有一枚炮弹不偏不倚奇迹般地落在了叛军设于广九车站的前敌指挥部内，竟然将正在用膳的赵成梁炸死了。
如此一来，群龙无首了，滇、桂军顿时乱作一团，人人吓得面如土色四处乱窜。
正在樟木头督战的杨希闵，闻报后亦大惊失色了；他见军心大乱，欲加弹压但已无济于事，将士纷纷顾自逃命，构筑的防线顿时都土崩瓦解了。
杨希闵想不到，战局会突变得如此之快，简直令人目眩不知所措了。
两年前，杨希闵率讨逆军入粤驱逐陈炯明时，是何等的英武荣光；岂料，今日竟会败得如此凄惨。杨希闵自知败局已定难以逆转，连八旗会馆的滇、桂联军司令部也不敢回了；赶紧带了几名亲随，经沙面租界逃往香港去了。
驻守瘦狗岭的刘震寰见杨希闵逃走，也无心再战，尾随着逃入香港。
于是，广州收复；广东政府只用了十天时间，就将杨希闵与刘震寰的叛乱平定了。
且，广东政府平定杨希闵、刘震寰叛乱之时，广西“新桂系”与滇军的争战尚未结束。
滇军龙云所部仍被困在南宁，一时难以脱身。
而由黟南进入桂北的唐继虞，虽是轻取了三江、融县、宜山等地；然而，行至柳州，就遭到了新桂系的阻截。
此时，“新桂系”只留下白崇禧继续与龙云对峙于南宁；李宗仁、黄绍竑会同范石生，集中兵力来对付唐继虞了。
唐继虞孤军一支，如何抵得三支劲旅合力夹攻，只得退回贵州去了，已攻取的三江、融县、宜山等地得而又失。
只是，当李宗仁、黄绍竑、范石生仨人合力在桂北驱逐唐继虞之时；唐继尧派遣的另一路援军、滇军第二军军长胡若愚所部，却由滇南的富宁入桂后沿右江而东；趁新桂系主力在桂北与唐继虞激战而未能脱身之机，迅速地进抵南宁；从而，使困于南宁的龙云突围而出解脱了。
待等李宗仁、黄绍竑、范石生仨人，
